LEA
Fakultät für Informatik der Technischen Universität München
Lehrstuhl für Effiziente Algorithmen
Postadresse: 80290 München; Hausadresse: Arcisstr.21, 80333 München
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Algorithmische Bioinformatik II (SS 02)


Aktuelle Hinweise:
* Das Skript ist jetzt vollständig verfügbar (v0.92 vom 02.09.02).
* Die Klausurergebnisse stehen fest.

* Dozent:
Prof. Dr. Ernst W. Mayr,
Dr. Volker Heun

* Bereich:
4 SWS Vorlesung Pflichtvorlesung für Studierende der Bioinformatik (Diplom/Bachelor)
Vertiefende Vorlesung im Bereich Informatik III (Theoretische Informatik), Gebiet Algorithmen

* Zeit und Ort:
Di 10h c.t. - 11:45, Hörsaal 0220
Fr 10h c.t. - 11:45, Hörsaal 0220

* Übung:
2 SWS Übung zur Vorlesung
Do 12h c.t. - 13:45, Hörsaal 1200
Übungsleitung: Moritz Maaß
Übungsschein: Einen Schein erhält, wer mindestens 40% der Punkte zu den Hausaufgaben erreicht und erfolgreich an der Semestralprüfung teilnimmt.
* Semestralprüfung:
Die Semestralprüfung wird in Form einer Klausur durchgeführt. Die Klausur findet am Dienstag, den 16.7. im Hörsaal 0601 von 10-13 statt. Hierzu ist auch ein separates Informationsblatt verfügbar.

* Hörerkreis:
Studierende der Bioinformatik
Studierende im Hauptstudium der Informatik
Studierende mit Nebenfach Informatik

* Voraussetzungen:
Stoff des Bioinformatik bzw. Informatik Grundstudiums
Algorithmische Bioinformatik I (empfehlenswert)

* Empfehlenswert für:
Erweiterte Kenntnisse im Bereich Algorithmen

* Inhalt:
  • Grundlagen der Biologie
  • Physical Mapping
  • Phylogenetic Trees
  • Hidden Markov Models
Es gibt auch eine aktualisierte Gliederung der Vorlesung.
* Weiterführende bzw. verwandte Vorlesungen:

* Skript:
Das Skript von Teil I sowie Ergänzungen zum Teil II sind erhältlich.
Weitere Materialien zur Vorlesung (nur innerhalb der Domain tum.de und lrz.de frei verfügbar)

* Literatur:
P. Clote, R. Backofen:
Computational Molecular Biology - An Introduction
Wiley, 2000.
R. Durbin, S. Eddy, A. Krogh, G. Mitchinson:
Biological Sequence Analysis - Probabilistic Models of Proteins and Nucleic Acids
Cambridge University Press, 1998.
D. Gusfield:
Algorithms on Strings, Trees, and Sequences - Computer Science and Molecular Biology
Cambridge University Press, 1997.
D.W. Mount:
Bioinformatics - Sequence and Genome Analysis
Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2001.
P.A. Pevzner:
Computational Molecular Biology - An Algorithmic Approach
MIT Press, 2000.
J. Setubal, J. Meidanis:
Introduction to Computational Molecular Biology
PWS, 1997.
M.S. Waterman:
Introduction to Computational Biology - Maps, Sequences and Genomes
Chapmann and Hall, 1995

* Sprechstunde:
siehe hier


heun@in.tum.de