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Dozent:
Prof. Dr. Ernst W. Mayr,
Dr. Volker Heun
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Bereich:
4 SWS Vorlesung
Pflichtvorlesung für Studierende der Bioinformatik
(Diplom/Bachelor)
Vertiefende Vorlesung im Bereich Informatik III (Theoretische
Informatik), Gebiet Algorithmen
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Zeit und Ort:
Di 10h c.t. - 11:45, Hörsaal 0220
Fr 10h c.t. - 11:45, Hörsaal 0220
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Übung:
2 SWS Übung zur Vorlesung
Do 12h c.t. - 13:45, Hörsaal 1200
Übungsleitung: Moritz Maaß
Übungsschein: Einen Schein erhält, wer
mindestens 40% der Punkte zu den Hausaufgaben erreicht und
erfolgreich an der Semestralprüfung teilnimmt.
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Semestralprüfung:
Die Semestralprüfung wird in Form einer Klausur durchgeführt.
Die Klausur findet am Dienstag, den
16.7. im Hörsaal 0601
von 10-13 statt.
Hierzu ist auch ein separates
Informationsblatt verfügbar.
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Hörerkreis:
Studierende der Bioinformatik
Studierende im Hauptstudium der Informatik
Studierende mit Nebenfach Informatik
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Voraussetzungen:
Stoff des Bioinformatik bzw. Informatik Grundstudiums
Algorithmische Bioinformatik I
(empfehlenswert)
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Empfehlenswert für:
Erweiterte Kenntnisse im Bereich Algorithmen
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Inhalt:
- Grundlagen der Biologie
- Physical Mapping
- Phylogenetic Trees
- Hidden Markov Models
Es gibt auch eine aktualisierte
Gliederung der Vorlesung.
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Weiterführende bzw. verwandte Vorlesungen:
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Skript:
Das Skript von Teil I sowie Ergänzungen
zum Teil II sind erhältlich.
Weitere Materialien zur Vorlesung (nur
innerhalb der Domain tum.de und lrz.de frei verfügbar)
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Literatur:
-
P. Clote, R. Backofen:
-
Computational Molecular Biology - An Introduction
Wiley, 2000.
-
R. Durbin, S. Eddy, A. Krogh, G. Mitchinson:
-
Biological Sequence Analysis -
Probabilistic Models of Proteins and Nucleic Acids
Cambridge University Press, 1998.
-
D. Gusfield:
-
Algorithms on Strings, Trees, and Sequences -
Computer Science and Molecular Biology
Cambridge University Press, 1997.
-
D.W. Mount:
-
Bioinformatics - Sequence and Genome Analysis
Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2001.
-
P.A. Pevzner:
-
Computational Molecular Biology - An Algorithmic Approach
MIT Press, 2000.
-
J. Setubal, J. Meidanis:
-
Introduction to Computational Molecular Biology
PWS, 1997.
-
M.S. Waterman:
-
Introduction to Computational Biology -
Maps, Sequences and Genomes
Chapmann and Hall, 1995
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Sprechstunde:
siehe hier
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